Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDKN3Q16667 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN3Q16667 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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