Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACKR1Q16570 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms