Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HLFQ16534 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HLFQ16534 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HLFQ16534 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms