Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC6Q16204 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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CCDC6Q16204 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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CCDC6Q16204 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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CCDC6Q16204 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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CCDC6Q16204 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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CCDC6Q16204 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC6Q16204 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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