Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ETFDHQ16134 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ETFDHQ16134 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms