Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8Q15843 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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