Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms