Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CDSNQ15517 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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