Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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