Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PCOLCEQ15113 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PCOLCEQ15113 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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