Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD6Q15008 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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