Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms