Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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COL19A1Q14993 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
COL19A1Q14993 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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