Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGB1Q14028 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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