Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CBFBQ13951 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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