Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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