Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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DNASE1L3Q13609 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNASE1L3Q13609 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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