Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms