Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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