Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATRQ13535 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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