Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AP3B2Q13367 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP3B2Q13367 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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