Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3BPQ13352 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGB3BPQ13352 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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