Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SKP2Q13309 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SKP2Q13309 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SKP2Q13309 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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