Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TRAF1Q13077 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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TRAF1Q13077 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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TRAF1Q13077 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAF1Q13077 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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