Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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