Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMA1Q12791 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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