Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF5Q12774 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF5Q12774 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
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