Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLFN5Q08AF3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms