Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PUDPQ08623 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms