Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP4F3Q08477 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms