Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TGM3Q08188 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms