Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNB3Q05901 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms