Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC6Q03468 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms