Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms