Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms