Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms