Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTA2P62736 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms