Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP25P60880 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms