Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms