Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms