Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms