Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HK3P52790 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HK3P52790 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HK3P52790 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms