Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE6CP51160 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE6CP51160 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms