Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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