Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPIAP49247 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPIAP49247 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms