Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TNNI2P48788 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms