Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIP4K2AP48426 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms