Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms