Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A2P43354 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A2P43354 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A2P43354 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms