Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3CBP42338 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms